Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP16Q9Y5T5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms