Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms