Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNSTRNQ9Y448 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms