Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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HCN4Q9Y3Q4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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HCN4Q9Y3Q4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN4Q9Y3Q4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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