Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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