Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF5Q9Y2D1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms