Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms