Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms