Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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