Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMKLBQ9ULI2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMKLBQ9ULI2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIMKLBQ9ULI2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms