Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms