Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms