Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYTH4Q9UIA0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms