Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms