Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms