Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1V8

SAMD15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD15Q9P1V8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SAMD15Q9P1V8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD15Q9P1V8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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