Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms