Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms