Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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FAM53CQ9NYF3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FAM53CQ9NYF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FAM53CQ9NYF3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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