Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSDC1Q9NW68 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms