Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms