Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms