Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms