Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO8Q9NRD0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms