Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms