Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRDM8Q9NQV8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms