Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms