Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms