Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSU72Q9NP77 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSU72Q9NP77 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms