Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VCX3AQ9NNX9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms