Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPR88Q9GZN0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms