Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms