Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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