Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms