Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms