Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM2Q9BVW6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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