Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms