Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms