Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms