Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOPXQ9BPY8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms