Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms