Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms