Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms