Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms