Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMIM12Q96EX1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms