Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms