Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C18orf8Q96DM3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms