Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPSB1Q96BD6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms