Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB3L1Q96BA8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms