Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms